treetime

TreeTime은 조상 서열 복원 및 분자 시계 계통수 추론을 위한 루틴을 제공합니다. 더 많은 정보: https://treetime.readthedocs.io/en/latest/tutorials.html.

• 공동 또는 주변 가능성을 최대화하여 조상 서열을 추론:

treetime ancestral

• 동형 유전 변이를 포함한 반복적인 돌연변이 패턴 분석:

treetime homoplasy

• 분자 시계 매개변수를 추정하고 계통수를 재설정:

treetime clock

• 호스트 또는 국가와 같은 이산적 특성을 계통수에 매핑:

treetime mugration