nextflow

계산 파이프라인 실행. 주로 생물정보학 워크플로우에 사용됩니다. 더 많은 정보: https://www.nextflow.io.

• 파이프라인 실행, 이전 실행의 캐시된 결과 사용:

nextflow run {{main.nf}} -resume

• GitHub에서 원격 워크플로우의 특정 릴리스 실행:

nextflow run {{사용자/저장소}} -revision {{릴리스_태그}}

• 중간 파일을 위한 작업 디렉토리를 지정하고 실행 보고서 저장:

nextflow run {{워크플로우}} -work-dir {{경로/대상/폴더}} -with-report {{보고서.html}}

• 현재 디렉토리에서 이전 실행의 세부 정보 표시:

nextflow log

• 특정 실행의 캐시 및 중간 파일 제거:

nextflow clean -force {{실행_이름}}

• 다운로드된 모든 프로젝트 나열:

nextflow list

• Bitbucket에서 원격 워크플로우의 최신 버전 가져오기:

nextflow pull {{사용자/저장소}} -hub bitbucket

• Nextflow 업데이트:

nextflow self-update