Die interne Datenstruktur eines Dateisystems, die eine geordnete Struktur und die Verfügbarkeit der Festplattendaten gewährleistet. Im Grunde genommen sind es die „Daten über die Daten“. Nahezu jedes Dateisystem besitzt seine eigene Metadatenstruktur. Hierin liegt zum Teil auch der Grund für die unterschiedlichen Leistungsmerkmale der verschiedenen Dateisysteme. Es ist von äußerster Wichtigkeit, die Metadaten intakt zu halten, da andernfalls das gesamte Dateisystem zerstört werden könnte.

Inodes enthalten alle möglichen Informationen über eine Datei, die Größe, die Anzahl der Links, Datum, Erstellungszeit, Änderungen, Zugriff sowie Zeiger (engl. pointer) auf die Festplattenblöcke, wo die Datei gespeichert ist.

Im Zusammenhang mit einem Dateisystem ist ein Journal eine platteninterne Struktur mit einer Art Protokoll, in das der Dateisystemtreiber die zu ändernden (Meta-)daten des Dateisystems einträgt. „Journaling“ verringert die Wiederherstellungszeit eines Linux-Systems enorm, da der Dateisystemtreiber keine umfassende Suche nach zerstörten Metadaten auf der gesamten Platte starten muss. Stattdessen werden die Journal-Einträge wieder eingespielt.